１/申請
專利權必須經過申請方能被授予。日本實行的是在先申請原則，相同發明在不同日期有了兩個以上的專利申請時，只有最先的專利申請人對發明可以獲得專利。

２/形式審查
檢查提交至 JPO 的申請文件是否符合程序和形式要求。如果文件沒有滿足必要的要求，將會被要求重新修正。

３/公開未經審查申請
自申請之日起 18 個月，JPO 將在公報上公開未經審查的申請文件。

４/實審請求
提交的專利申請不一定會被實質審查。只有當申請人或第三方要求審查并支付審查費后會進行實質審查。

５/視為撤回
自申請之日起 3 年內未要求實質審查的申請，將自動被視為撤回，不能授予專利。

６/實質審查
專利局長指派審查員審查專利申請，決定申請內容是否可以授予專利。在審查過程中，首先審查是否滿足法律的規定，即審查是否存在駁回的理由。

７/發出駁回意見通知
凡有申請不符合實質性要求，JPO 將發送闡明駁回理由的通知。

８/提交意見書、補正書
申請人可針對駁回的理由，提交書面意見或修訂內容。
 
９/授予專利
如果審查員發現在審查階段沒有不予授予專利的情況，則同意授予專利。在評估書面意見／修訂后，沒有不予授予專利的情況，則同意授予專利。

10/駁回
如果申請人提交的書面意見或修訂不足以消除駁回的理由，并且審查員審定該申請不適于授予專利，則拒絕授予專利。

11/請求復審
當對駁回的決定不服時，當事人可以請求復審。

12/復審審查
復審委員會 3－5 名成員組成合議小組。 在審查過程中，如果駁回的理由被排除，則授予專利注冊；如果駁回的理由繼續存在，則繼續執行不予注冊的決定。

13/注冊（支付注冊費）
在申請人支付注冊費并且授予專利的決定作出后，注冊專利權即生效。同時，該發明獲得一個專利號。注冊后，JPO 將給專利權人寄送專利證書。

14/公告
專利公報刊登專利權內容。

15/請求無效復審
專利權被授予之后，利害關系人可以請求專利無效復審。

16/復審審查
復審委員會 3 至 5 名成員組成合議小組對專利無效復審進行審查。 如果合議小組認為專利授予無瑕疵，則作出維持專利決定；如果審查員發現授予的專利存在瑕疵，則會作出專利權無效的決定。

17/知識產權高等法院
對任何決定或裁定不服的利害關系人，可以上訴至知識產權高等法院。